B细胞和T细胞受体对抗原的识别
为了识别和清除机体接触到的广泛病原体，获得性免疫系统中的淋巴细胞已经进化到可以识别来自于细菌、病毒以及其他病原体等各种各样不同的抗原。B细胞的抗原识别分子为免疫球蛋白。这些由B细胞产生的蛋白具有广泛的抗原特异性，而每一个B细胞所产生的免疫球蛋白其特异性是单一的。B细胞表面作为其抗原受体的膜结合型免疫球蛋白即为B细胞受体。具有相同抗原特异性的免疫球蛋白即抗体是由B细胞的最末分化状态——浆细胞所分泌的。分泌的抗体在机体内与细胞外的病原体及其毒性产物结合，这是获得性免疫应答中B细胞的主要效应功能。
抗体是特异性免疫识别中第一个被确定的分子，也是被了解最为详细的分子。抗体分子具有两种独立的功能：第一就是特异性地结合病原体中引发免疫应答的抗原分子；另外一个功能就是抗体与病原体结合后，招募其他细胞和分子来杀伤病原体。例如：被抗体结合而中和的病毒或标记的病原体可以被巨噬细胞和补体所破坏。这些功能是由抗体分子中的不同结构域承担的，其中有些分子的结构域是用来特异性地识别并与病原体或者抗原结合，而另外的结构域则涉及不同的效应机制。不同抗体分子间的抗原结合区域其差异是非常大的，因此被称为可变区或V区。这种抗体分子的多样性使得每一个抗体能够结合各自不同特异性的抗原，而一个个体产生的总的抗体库就足以使他能够识别任何实际存在的结构。而抗体分子中负责在免疫系统中发挥效应功能的区域并不像可变区那样多变，我们称之为恒定区或C区。它们主要以五种不同的形式存在，分别特异性激活不同的效应机制。膜结合型的B细胞受体由于其C区插入并维持在B细胞膜上，因此这些受体不具有这些效应功能。它们仅仅是通过暴露在细胞表面的V区去识别和结合抗原，发挥其受体的功能，从而将信号传递到细胞内部，引发B细胞的活化，最终导致细胞克隆扩增并产生特异性抗体。
T细胞的抗原识别分子只存在膜结合型的蛋白形式，只能发挥转导信号并激活T细胞的功能。这些T细胞受体与免疫球蛋白不仅在结构上相似——具V区和C区，而且它们产生多样性的遗传机制也是相似的。但是T细胞受体与B细胞受体最重要的一个差别就是： T细胞受体不能直接识别和结合抗原，而是识别与其他细胞表面MHC分子结合的病原体蛋白抗原的短肽段。
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