公路运输的主要缺点在于：
（1）运输能力小，每辆普通载重汽车每次只能运送5吨货物，长途客车可送50位旅客，仅相当于一列普通客车的1／30～1／36；
（2）运输能耗很高，分别是铁路运输能耗的10.6～15.1倍，是沿海运输能耗的11.2～15.9倍，是内河运输的113.5～19.1倍，是管道运输能耗的4.8～6.9倍，但比民航运输能耗低，只有民航运输的6％～87％；
（3）运输成本高，分别是铁路运输的11.1～17.5倍，是沿海运输的27.7～43.6倍，是管道运输的13.7～21.5倍，但比民航运输成本低，只有民航运输的6.1％～9.6％；
（4）劳动生产率低，只有铁路运输的10.6％，是沿海运输的1.5％，是内河运输的7.5％，但比民航运输劳动生产率高，是民航运输的3倍；此外，由于汽车体积小，无法运送大件物资，不适宜运输大宗和长距离货物，公路建设占地多，随着人口的增长，占地多的矛盾将表现得更为突出。
因此，公路运输比较适宜在内陆地区运输短途旅客、货物，因而，可以与铁路、水路联运，为铁路、港口集疏运旅客和物资，可以深入山区及偏僻的农村进行旅客和货物运输；在远离铁路的区域从事干线运输。
运量较小，运输成本较高
目前，世界上最大的汽车是美国通用汽车公司生产的矿用自卸车，长20多米，自重610t，载重350t左右，但仍比火车、轮船少得多；由于汽车载重量小，行驶阻力比铁路大9～14倍，所消耗的燃料又是价格较高的液体汽油或柴油，因此，除了航空运输，就是汽车运输成本最高了。
运行持续性较差
据有关统计资料表明，在各种现代运输方式中，公路的平均运距是最短的，运行持续性较差。如我国1998年公路平均运距客运为55km，货运为57km，铁路客运为395km，货运为764km。
安全性较低，污染环境较大
据历史记载，自汽车诞生以来，已经吞吃掉3000多万人的生命，特别是20世纪90年代开始，死于汽车交通事故的人数急剧增加，平均每年达50多万。这个数字超过了艾滋病、战争和结核病人每年的死亡人数。汽车所排出的尾气和引起的噪声也严重地威胁着人类的健康，是大城市环境污染的最大污染源之一。
1.时间控制的不准确，
2，市场已饱满，利润低
3，油价上涨，成本提高
公路运输 - 不协调因素
经过20多年的快速发展，中国公路运输能力和水平都有了很大提高，公路交通在国民经济中的基础性地位和作用显著增强，对经济发展和社会进步的推动作用越来越大，但是也存在许多突出问题。
目前中国公路货物运输中明显存在六个不协调：
公路货运的发展水平和经济社会发展要求不协调，
货运装备的水平和结构与高等级公路发展要求不协调，
运输企业运营模式和组织形式与现代物流业发展要求不协调，
运输管理的能力和水平与运输市场发展要求不协调，
货运组织的信息化程度与现代货物运输发展要求不协调，
以及运输管理体制与货运现代化要求不协调。
另外，中国的公路货运特别是货运工具的水平和运输效率与欧美等发达国家之间也存在巨大的差距。与会者认为，上述问题在很大程度上吞噬了中国由廉价的劳动力、土地等生产要素和低成本的投资环境所带来的制造业的竞争优势，严重影响了经济社会的发展
随着经济全球化进程的加快和市场竞争的日益加剧，一个高效、便捷、安全的公路货运系统和物流配送体系，不仅成为地区和国家投资环境的重要组成部分，也日益成为决定地区和国家制造业竞争力的重要因素。因此，实现公路货运现代化和提高货运装备的水平，已经成为提高国家竞争力的一项重要的基础性任务。
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