分光光度计测核酸蛋白时A260A280 和 A260A230 的含义以及注意的问题

发布时间:2018-08-10 10:55:00   来源:文档文库   
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分光光度计测核酸蛋白时A260/A280 A260/A230 的含义

(一)

1A260nm 是核酸最高吸收峰的吸收波长,最佳测量值的范围为 0.1 1.0 如果不在此范围,稀释或浓缩样品,使之在此范围内;如果吸光 度小于 0.05,检查是否存在操作因素(如移液不准确,样品内有 悬浮物等) 影响。 DNA 样品的 A260 吸光度值是否>0.1 (请注意, 这个值跟仪器无关,核酸的吸光度必需大于 0.1,其值才有效和可 靠,因为样品中的杂质和颗粒这些不纯物的干扰通常会对光有一 定吸收,其值<0.1 

2A280nm 是蛋白和酚类物质最高吸收峰的吸收波长,比值可进行核酸样品纯度评估:纯 DNA A260/A280 比值为 1.8,纯 RNA 2.0。如果 比值低,表示受到蛋白(芳香族)或酚类物质的污染,需要纯化 样品。比值=1.5 相当于 50%蛋白质/DNA 溶液

3A230nm是碳水化合物最高吸收峰的吸收波长,比值可进行核酸样品纯度 评估:纯 DNA RNA A260/A230 比值为 2.5。若比值小于 2.0 标明样品被碳水化合物(糖类) 、盐类或有机溶剂污染,需要纯化 样品。A230 产生负值主要是由于在很低 DNA 浓度的溶液中的一些 其他成分的干扰所导致的。在下一个测定中,需要降低样品的稀 释度,A230 的负值会被校正。

4 A320nm A340nm 为检测溶液样品的浊度和其他干扰因子。该值应该接近 0.0。如果 不是,标明溶液中有悬浮物,需要纯化样品。纯样品的 A320 一般 0

5A260/A280 A260/A230 是核酸纯度的指示值,纯度好的 DNA,在 pH7-8.5 下其比值应该 2.0 2.5A260 / A280 的比值, 用于评估样品的纯度, 因为蛋白的吸收峰是 280 nm 纯净的样品比值大于 1.8DNA)或 2.0RNA)。如果比值低于 1.8 或者 2.0,表示存在蛋白质或者 酚类物质的影响。 A230 是多肽、芳香基团、苯酚和一些碳氢化合物的吸光度,A230 表示样品中存在一些污染物,如碳水化合物、多肽、苯酚等,较 纯净的核酸 A260/A230 的比值大于 2.0

6A280 是蛋白质的吸光度。纯净的 DNA RNA A260 A280 都有吸收值,但以 260 最高。 而核酸提取过程中最主要的污染物蛋白质在 A280 处有强烈的吸收 值,所以计算这两个吸收峰的比值就可以确定核酸的纯度。DNA 的这个值一般是 1.82.0,而 RNA 则是 2.0。值得注意的是,这个比值并不能很好的反应出核酸的纯度,简单来说寡聚核酸会造成 A260 值升高,如果核酸有降解,则会导致 A260/A280 值上升。另外,如果 A280 值偏高,并不一定是蛋白污染。蛋白在 A280 有吸 收值是因为其苯丙氨酸等氨基酸残基中所含有的苯环的缘故,所 有含苯环的化合物都会在 A280 有吸收峰。所以如果 A280 升高虽 然有最有可能是蛋白污染,但也有可能是其他苯环物质。如植物 DNA 提取过程中的多酚类物质污染。另外,如果要求高的话,我们 还会要求测量 A230 的值,正常情况下,核酸的 A260/A230 A260/A280 是一致的, 如果这个值上升则样品可能会含有多糖类的污染。

(二)

A280nm, A270nm 是蛋白最高吸收峰的吸收波长,比值可进行核酸样品纯度评估:纯 DNA A260/A280 比值为 1.8 RNA 2.0。如果比值低,表示受到蛋白(芳香族)或酚类物质的污染,需要纯化样品。比值=1.5 相当于 50%蛋白质/DNA 溶液.酚的最大吸收峰在 270nm

A230nm 是碳水化合物最高吸收峰的吸收波长, 比值可进行核酸样品纯度评估: DNA RNA A260/A230 比值为 2.5。若比值小于 2.0 标明样品被碳水化合物(糖类)、盐类或有机溶剂污染,需要纯化样品。 A230 产生负值主要是由于在很低 DNA 浓度的溶液中的一些其他成分的干扰所导致的。在下一个测 定中,需要降低样品的稀释度,A230 的负值会被校正。

A320nm A340nm 为检测溶液样品的浊度和其他干扰因子。该值应该接近 0.0。如果不是,标明溶液中有悬浮物,需要 纯化样品。纯样品的 A320 一般是 0

A260/A280 A260/A230 是核酸纯度的指示值。 纯度好的 DNA RNA pH7-8.5 A260 / A280 的比值应该在 2.0 2.5 在纯净的样品比值大于 1.8DNA)或者 2.0RNA)。如果比值低于 1.8 或者 2.0,表示存在蛋白质或 者酚类物质的影响。A230 表示样品中存在一些污染物,如碳水化合物、盐(胍盐)等,较纯净的核 A260/A230 的比值大于 2.0 0.5BSA 蛋白质污染时,蛋白污染会导致 260 280 的数值都下降,其净结果是 260/280 比值下 降, 260/280 的比值变化并不显著, 但正如分子克隆3所说。但蛋白残留会导致 230 的数值显著上升, 显著影响 260/230 的比值。也就是说,如果 RNA 样品的 260/2801.7260 /2300.5,那么就应该考 虑污染原因不是胍盐残留,而是蛋白残留. 酚的最大吸收峰在 270。酚的残留会显著的增加 230260 280 的数值,同时酚的吸收峰与核酸的 吸收峰合并后,最大吸收峰向 270 方向偏移,也就是说最大吸收峰在 270 附近。也就是说,如果 RNA 如果 样品的 260/280=1~1.5, 260/230=1~1.5,那么污染原因就应该考虑是酚残留。那么污染原因就应该考虑是酚残留。 胍盐对 RNA 样品吸收有显著影响,会在小于 230nm 处产生大的吸收峰。胍盐残留不会影响 260 280 的数值,对 260/280 的比值不会造成大的影响,当然也不影响 RNA 定量。但胍盐残留对 260/230 比值 具有明显影响。例如本例中 260/230 的比值小于 0.21 时,260/280 的比值还>2。也就是说,如果 RNA 如果 样品的 260/280>=2260/230<1,那么污染原因就应该考虑是胍盐残留,那么污染原因就应该考虑是胍盐残留。 其他: 用分光光度计测量 RNA 时,用水而不是用 TE 缓冲液稀释 RNA 样品会造成 A260/A280 比值下降。 原因是低离子强度和低 pH 溶液会增加 280 nm 处的光吸收值。 那样就很容易被蛋白污染, 加氯仿离心后取上清的时候千万不要贪多,那样就很容易被蛋白污染 所以现在一般取 400ul左右。 260/230<1 时,只有两种情况。一是胍盐污染,二是蛋白污染。

本文来源:https://www.2haoxitong.net/k/doc/7dd0911aac02de80d4d8d15abe23482fb4da02b5.html

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