利用Excel进行主成分分析的具体操作

发布时间:2019-06-12 12:34:58   来源:文档文库   
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1 利用Excel2000进行主成分分析

举例如下:

第一步,录入数据,并对进行标准化。

【例】一组古生物腕足动物贝壳标本的两个变量:长度和宽度。

1 原始数据和标准化数据及其均值、方差

(取自张超、杨秉庚《计量地理学基础》)

计算的详细过程如下:

将原始数据绘成散点图2)。主持分分析原则上要求数据具有线性相关趋势——如果数据之间不相关(即正交),则没有必要进行主成分分析,因为主成分分析的目的就是用正交的变量代替原来非正交的变量;如果原始数据之间为非线性关系,则有必要对数据进行线性转换,否则效果不佳。从2 可见,原始数据具有线性相关趋势,且测定系数R2=0.4979,相应地,相关系数R=0.7056

对数据进行标准化。标准化的数学公式为

这里假定按列标准化,式中

分别为第j列数据的均值和标准差,为第i行(即第i个样本)、第j列(即第j个变量)的数据,为相应于的标准化数据,为样本数目。

2 原始数据的散点图

3 标准化数据的散点图

对数据标准化的具体步骤如下: 求出各列数据的均值,命令为average,语法为:

average(起始单元格:终止单元格)。如图1所示,在单元格B27中输入“=AVERAGE(B1:B26)”,确定或回车,即得第一列数据的均值;然后抓住单元格B27的右下角(光标的十字变细)右拖至C27,便可自动生成第二列数据的均值

求各列数据的方差。命令为varp,语法同均值。如1所示,在单元格B28中输入“=VARP(B2:B26)”,确定或回车,可得第一列数据的方差,右拖至C28生成第二列数据的方差

求各列数据的标准差。将方差开方便得标准差。也可利用命令stdevp直接生成标准差,语法和操作方法同均值、方差,不赘述。

标准化计算。如1所示,在单元格D2中输入“=(B2-$B$27)/$B$29”,回车可得第一列第一个数据“3”的标准化数值-1.786045,然后按住单元格D2的右下角下拖至D26,便会生成第一列数据的全部标准化数值;按照单元格D2的右下角右拖至E2,就能生成第二列第一个数据“2”的标准化数据-1.806077,抓住单元格E2的右下角下拖至E26便会生成第二列数据的全部标准化数值。

作标准化数据的散点图(3)。可以看出,点列的总体趋势没有变换,两种数据的相关系数与标准化以前完全相同。但回归模型的截距近似为0,即有,斜率等于相关系数,即有

求标准化数据的相关系数矩阵或协方差矩阵。求相关系数矩阵的方法是:沿着“工具(T)”“数据分析(D)”的路径打开“分析工具(A)”选项框(4),确定,弹出“相关系数”对话框(5),在“输入区域”的空白栏中输入标准化数据范围,并以单元格G1为输出区域,具体操作方法类似于回归分析。确定,即会在输出区域给出相关

4 分析工具选项框

5 相关系数对话框

系数矩阵的下三角即对角线部分,由于系对称矩阵,上三角的数值与下三角相等,故未给出(6),可以通过“拷贝——转置——粘帖”的方式补充空白部分。

6 标准化数据的相关系数和协方差

求协方差的方法是在“分析工具”选项框中选择“协方差”(7),弹出“协方差” 选项框(8),具体设置与“相关系数”类似,不赘述。结果见6,可以看出,对于标准化数据而言,协方差矩阵与相关系数矩阵完全一样。因此,二者任取其一即可。

7 在分析工具选项框中选择“协方差”

8 协方差选项框

计算特征根。我们已经得到相关系数矩阵为

而二阶单位矩阵为

于是根据公式,我们有

按照行列式化为代数式的规则可得

根据一元二次方程的求根公式,当时,我们有

据此解得(对于本例,显然)。这便是相关系数矩阵的两个特征根。

求标准正交向量。将代入矩阵方程,得到

在系数矩阵中,用第一行加第二行,化为

由此得,令,则有,于是得基础解系

,单位化为

单位化的公式为)。

完全类似,将代入矩阵方程,得到

用系数矩阵的第二行减去第一行,化为

于是得到,取,则有,因此得基础解系为

,单位化为

这里便是标准正交向量。

求对角阵。首先建立标准正交矩阵P,即有

该矩阵的一个特殊性质便是,即矩阵的转置等于矩阵的。根据,可知

下面说明一下利用Excel进行矩阵乘法运算的方法。矩阵乘法的命令为mmult,语法是mmult (矩阵1的单元格范围,矩阵2的单元格范围)。例如,用矩阵与矩阵C相乘,首先选择一个输出区域如G1:H2,然后输入“=mmult(A1:B2,C1:D2)”,然后按下“Ctrl+Shift+Enter”键(9),即可给出

再用乘得的结果与P阵相乘,便得对角矩阵

如果希望一步到位也不难,选定输出区域如C3:D4,然后输入“=mmult(mmult(A1:B2,C1:D2),E1:F2) 10,同时按下“Ctrl+Shift+Enter”键,立即得到结果(11)。显然,对角矩阵对角线的数值恰是相关系数矩阵的特征值。

9 矩阵乘法示例

10 矩阵连乘的命令与语法

至此,标准化的原始变量x与主成分之间z之间可以表作

显然之间正交。

11 乘法结果:对角矩阵

根据特征根计算累计方差贡献率。现已求得第一特征根为,第二特征根为,二者之和刚好就是矩阵的维数,即有,这里m=2为变量数目(注意前面的n=25为样本数目)。比较610中给出的相关系数矩阵C11中给出的对角矩阵D可以看出,Tr.(C)=1+1=2Tr.(D)=1.7056+0.2944=2,即有Tr.(C)= Tr.(D),可见将相关系数亦即协方差矩阵转换为对角矩阵以后,矩阵的trace,即对角线元素之和)没有改变,这意味着将原始变量化为主成分以后,系统的信息量没有减少。现在问题是,如果我们只取一个主成分代表原来的两个变量,能反映原始变量的多少信息?这个问题可以借助相关系数矩阵的特征根来判断。利用Excel容易算出,第一特征根占特征根总和即矩阵维数的85.28%见下表),即有

也就是说:

1.7056

0.2944

2

这表明,如果仅取第一个主成分,可以反映原来数据85.28%的信息——换言之,舍弃第二个主成分,原来数据的信息仅仅损失14.72%,但分析变量的自由度却减少一个,整个分析将会显得更加简明。

计算主成分载荷。根据公式,容易算出

计算公因子方差和方差贡献。根据上述计算结果可以比较公因子方差和方差贡献。再考虑全部的两个主成分的时候,对应于的公因子方差分别为

对应于第一主成分z1和第二主成分z2的方差贡献分别为

可以看出(12): 第一,方差贡献等于对应主成分的特征根,即有

第二,公因子方差相等或彼此接近,即有

第一,公因子方差之和等于方差贡献之和,即有

第一个规律是我们决定提取主成分数目的判据与之一,第二个规律是我们判断提取主成分数目是否合适的判据之一,第三个规律是我们判断提取主成分后是否损失信息的判据之一。去掉次要的主成分以后,上述规律理当仍然满足。这时如果第二个规律不满足,就意味着主成分的提取是不合适的。此外,上述规律也是我们检验计算结果是否正确的判据之一。

12 公因子方差、方差贡献的计算结果及其与特征根的贡献

计算主成分得分。根据主成分与原始变量的关系,应有

或者

对于本例而言,式中

这里为前面计算的标准化特征向量。于是有

化为代数形式便是

式中的x均为标准化数据。对进行转置,可得

13 计算特征向量的公式及语法

14 计算主成分得分

根据这个式子,利用Excel计算主成分得分的步骤如下:

将特征向量复制到标准化数据的附近;

选中一个与标准化数据占据范围一样大小的数值区域(如G2:H26);

输入如下计算公式“=mmult(标准化数据的范围,特征向量的范围)”,在本例中就是“=MMULT(B2:C26,E2:F3)”(13);

同时按下“Ctrl+Shift+Enter”键。

计算主成分得分的均值和方差,可以发现,均值为0(由于误差之故,约等于0),方差等于特征根。

最后,可以对主成分得分进行标准化。已知主成分得分的均值为0,我们不按总体方差进行标准化,而按样本方差进行标准化。

15 主成分得分的标准化结果

样本方差的计算公式为

相应地,标准差为

标准化公式同前面给出的一样。结果见15。注意,这里之所以按样本方差进行标准化,主要目的是为了与SPSS的计算结果进行比较。

分别以z1z2为坐标轴,将主成分得分(包括标准化的得分)点列标绘于坐标图中,可以发现,点列分布没有任何趋势:回归结果表明,回归系数和相关系数均为零,即有1617)。这从几何图形上显示:主成分之间是正交的,即有(试将161723对比)。

16 主成分得分的相关系数为零

17 主成分得分的相关系数为零(标准化)

最后可以验证因子载荷即为(标准化)原始数据与主成分得分之间的相关系数,容易算出

18的关系及其回归方程

19的关系及其回归方程

20的关系及其回归方程

21的关系及其回归方程

回归方程为

方程的系数恰是以下矩阵的元素

本文来源:https://www.2haoxitong.net/k/doc/43337d0b64ce0508763231126edb6f1afe007157.html

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