化学软件应用
Chembiodraw Ultra 12.0
结构式与命名相互转换
Chemdraw Ultra 12.0提供了多个绘图工具以方便用户绘制化学图形,其中绘制化学结构的核心工具包括9个键工具,10个环工具和一个脂肪链工具。除此之外,还有各种大大小小的功能,本内容主要介绍菜单栏中Structure里几个命令的功能:如结构式与命名如何进行转换,结构式的检查及标准化。
Chemdraw既可根据化学结构命名。也可根据化学名称画出化学结构。
一般情况下,Chemdraw采用IUPAC系统命名法命名化学结构,它能自动识别杂环结构,同时也支持Cahn-Ingold-Prelog规则。将结构式命名,可以采取3种方法来实现。
第1种方法,以N-苯乙基乙酰胺为例,选取整个结构式,单击菜单栏中的“Structure”→ “Convert Structure to Name”命令,此时在结构式的正下方显示出N-苯乙基乙酰胺的IUPAC名称为“N-phenethylacetamide”;如图所示:
利用“套索”或“蓬罩”工具将整个结构式选中,然后单击菜单栏中的“Structure”→ “Convert Structure to Name”命令,
此时在结构式的正下方显示出IUPAC名称N-phenethylacetamide。
第2种方法,在选中的结构式上右击,然后在弹出的快捷菜单中选择“Analysis”→“Name”命令,则可得到该结构的IUPAC名称;
第3种方法,利用快捷键快速命名,先选取整个结构式,然后使用组合键
Chemdraw可将一个化合物的英文名称直接转化为化学结构式。除了能够将采用官方命名规则(IUPAC命名规则,IUBMB命名规则及CAS命名规则)命名的英文名称转换为化学结构外,还能直接将常用的俗称直接转换成化学结构。以“N-苯乙基乙酰胺”的化学结构为例,单击菜单栏中的“Structure”→“Convert Name to Structure”命令,弹出“Insert Structure”对话框,在对话框的空白处输入名称“N-phenethylacetamide”,单击“OK”按钮,即可获得“N-苯乙基乙酰胺”的结构。如图所示:
单击菜单栏中的“Structure”→“Convert Name to Structure”命令,
弹出“Insert Structure”对话框,在对话框的空白处输入名称“N-phenethylacetamide”,
单击“OK”按钮,即可获得“N-苯乙基乙酰胺”的结构。
另一种方法,即使用组合快捷键,使用
同时,Chemdraw还能对一些常见的输入错误自动矫错。例如,在输入N-苯乙基乙酰胺的名称时“N-phenethylacetamide”时,因为大意写错了一个字母,写成了“N-phenethylacetamode”,Chemdraw将自动弹出一个对话框,提示正确的名称是“N-phenethylacetamide”,单击“确定”按钮,系统自动纠正书写错误,并给出正确结构。如果提示是否自动纠正时单击“取消”按钮,系统将认为结构错误,不会给出结构式。
当输入错误的名称:“N-phenethylacetamode”时
单击“OK”会出现一个对话框,提示书写错误,并提示正确的输入名称,点击确定会得出正确的结构式,
如果点击取消,则系统认为结构错误,不会给出结构式。
利用Chemdraw绘制完结构式后,可以利用“Structure”→ “Check structure”命令检查一下结构式是否正确。
结构式无误,则出现如下对话框:
仍然以上面的N-苯乙基乙酰胺为例,首先复制所示化合物,在该化合物被选择的情况下,选择透视工具,然后将光标置于被选择的结构式上,选择“Structure”→“Clean up structure”命令,使结构式标准化。
本文来源:https://www.2haoxitong.net/k/doc/243c7b7402768e9951e7383d.html
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