内参即是内部参照，它们在各组织和细胞中的表达相对恒定，在检测基因的表达水平变化时常用它来做参照物。常用的PCR内参有GAPDH、β-actin、18sRNA、28sRNA、B2M、ACTB、SDHA、HPRT1、ARBP内参基因等
正向引物（上游引物）是沿着负链进行不间断延长的反向引物（下游引物）是沿着正链进行一段段延长的正链是含有目的基因的那条链。
RT-PCR为反转录RCR（reversetranscriptionPCR）和实时PCR（realtimePCR）共同的缩写。逆转录PCR，或者称反转录PCR(reversetranscription-PCR,RT-PCR，是聚合酶链式反应(PCR的一种广泛应用的变形。在RT-PCR中，一条RNA链被逆转录成为互补DNA，再以此为模板通过PCR进行DNA扩增。
由一条RNA单链转录为互补DNA(cDNA称作“逆转录”，由依赖RNA的DNA聚合酶（逆转录酶）来完成。随后，DNA的另一条链通过脱氧核苷酸引物和依赖DNA的DNA聚合酶完成，随每个循环倍增，即通常的PCR。原先的RNA模板被RNA酶H降解，留下互补DNA。RT-PCR的指数扩增是一种很灵敏的技术，可以检测很低拷贝数的RNA。RT-PCR广泛应用于遗传病的诊断，并且可以用于定量监测某种RNA的含量。（检测基因表达的方法，参见NorthernBlot法。
RT-PCR的关键步骤是在RNA的反转录，要求RNA模版为完整的且不含DNA、蛋白质等杂质。常用的反转录酶有两种，即鸟类成髓细胞性白细胞病毒（avianmyeloblastosisvirus,AMV）反转录酶和莫罗尼鼠类白血病病毒（moloneymurineleukemiavrius,MMLV）反转录酶。
RT-PCR有时候也会指代实时PCR(real-timePCR。为了与逆转录PCR相区别，通常被写作“定量PCR”(quantitativePCR或者RTQ-PCR(real-timequantitativePCR。
3实时PCR
实时PCR(real-timePCR，属于定量PCR（Q-PCR）的一种，以一定时间内DNA的增幅量为基础进行DNA的定量分析。
realtimePCR的定量使用荧光色素，目前有二种方法。一种是在dsDNA中插入特异的荧光色素，例如SYBRGreen荧光染料；另一种使用一种能与增幅DNA序列中特定寡核酸序列相结合的一种荧光探针（probe），如Taqman探针。两种方法原理不同。SYBRGreen荧光染料游离时不发光，当反应体系中存在双链DNA时，SYBRGreen与双链DNA结合，此时才发光。 